Malus sylvestris est un petit arbre, parfois un arbuste.
Sa croissance est moyenne voire lente.
Ses rameaux sont parfois épineux.
Feuilles alternes, elliptiques à ovales, dentées en scie, elles se terminent par une pointe courte.
Elles sont tomenteuses, à poils courts et denses à l'état jeune devenant glabres.

Grandes fleurs, 3cm, blanches, teintées de rose, groupées en bouquets dressés de 4 à 8.
15 à 50 étamines, anthères jaunes, 2 à 5 styles soudés à la base.
Petites pommes, de 2 à 4cm, jaune verdâtre, teintées de rouge, à saveur âcre et acide.

Le Pommier sauvage, ou Pommier des bois, spontané dans toute l'Europe tempérée est d'origine encore méconnue.
Il n'est pas l'ancêtre du Pommier domestique, Malus domestica, dont on sait maintenant que le génome vient principalement d'une espèce d'Asie centrale.
Très rustique, il croît sur des sols frais, riches, calcaires et en situation ensoleillée, jusqu'à 1400m, mais il est devenu très rare.